Eltérően kezelik a magyar történelmi egyházak az egyre súlyosbodó járványhelyzetet.
A Magyar Református Egyház a zárás mellett döntött. Határozatuk szerint 2021. március 8. és 26. között terjedő időszakban minden, személyes jelenléttel járó istentisztelet, gyülekezeti alkalom és összejövetel szünetel. Istentiszteleteket és gyülekezeti alkalmakat digitális eszközök segítségével, a gyülekezet helyi lehetőségeinek figyelembevételével tartanak. Arra kérnek minden lelkipásztort és presbitériumot, hogy ebben a rendkívüli helyzetben is találjanak módot a bajba jutottak, betegek és magányosok lelki támogatására, és nyújtsanak segítséget az erre rászorulóknak. A nagyheti és húsvéti istentiszteletek rendjéről március 26-án dönt a Zsinat Elnökségi Tanácsa.
A katolikus templomokban továbbra is lehet nyilvános istentiszteleteket tartani. Azzal indokolta a Magyar Katolikus Püspöki Konferencia mindezt, hogy a koronavírus miatt meghirdetett veszélyhelyzetben a templomok mint a lelki feltöltődés és imádság helyei különösen is fontosak. Az egyes megyés püspökök ettől eltérő rendelkezéseket is hozhatnak. Szeged-Csanád Egyházmegyében a templomokban a nyilvános szentmisék, liturgiák szünetelnek. A templomok nyitva vannak egész nap, lehetőséget adva a híveknek a személyes imádságra.A szentségek kiszolgáltatása a korábban megküldött római rendelkezések alapján történhet. A temetési gyászmiséket egy későbbi időpontra kell halasztani, amikor már lehetségessé válik az elvégzésük.
Azt javasolja a Magyarországi Evangélikus Egyház püspöki tanácsa a gyülekezeteknek, hogy virágvasárnapig ne tartsanak nyilvános istentiszteleteket.